Las áreas elegibles del Interreg POCTEP 2021–2027 cubren las regiones fronterizas entre España y Portugal, organizadas en seis Áreas de Cooperación (AC):
- Galicia / Norte de Portugal
- Norte de Portugal / Castilla y León
- Castilla y León / Centro de Portugal
- Centro / Extremadura / Alentejo
- Alentejo / Algarve / Andalucía
- Área multirregional para proyectos que abarquen más de una zona fronteriza
El programa incluye 36 regiones NUTS III elegibles:
ESPAÑA (15 NUTS III):
A Coruña, Lugo, Ourense, Pontevedra, Ávila, León, Salamanca, Valladolid, Zamora, Badajoz, Cáceres, Cádiz, Córdoba, Huelva, Sevilla.
PORTUGAL (21 NUTS III):
Alto Minho, Cávado, Ave, Área Metropolitana do Porto, Alto Tâmega, Tâmega e Sousa, Douro, Terras de Trás-os-Montes, Algarve, Oeste, Região de Aveiro, Região de Coimbra, Região de Leiria, Viseu Dão-Lafões, Beira Baixa, Médio Tejo, Beiras e Serra da Estrela, Alentejo Litoral, Alto Alentejo, Alentejo Central, Baixo Alentejo.
Además, POCTEP define áreas funcionales para estrategias integradas de desarrollo local, como la Reserva de la Biosfera Gerês-Xurés y la región del Bajo Guadiana, que permiten una cooperación transfronteriza más focalizada.